martes, 13 de octubre de 2020

CLASE # 5 LIS Y LIMS SISTEMAS DE INFORMACIÓN DE LABORATORIO DE ANÁLISIS CLÍNICOS

 

Antes que nada vamos a recordar un poco la situación de los laboratorios de análisis clínicos del sector público, vamos a observar primero lo que pasa desde que el doctor del consultorio le da la orden a un paciente para que se realice estudios de laboratorio y lo que pasa cuando éste acude a programar su cita.

Supngamos que el doctor le solicita a cada paciente el cuadro básico que consiste en 4 pruebas:

*Biometría Hemática

*Química Sanguínea

*EGO Examen general de orina

*Examen Coproparasitológico


Y por favor no olviden que el laboratorio atiende estudios diarios tanto de pacientes hospitalizados como de pacientes de consulta externa,

Veamos ese laboratorio, les voy a pasar sólo algunas de mis diapositivas por aquí, ya saben que si desean tener todo el power point que he elaborado la tienen que solicitar a mi email por razones de espacio en memoria.


Figura 1: Mañana en la sala de espera del laboratorio, pacientes esperando para ser llamados a que les tomen sus muestras para el análisis



Figura 2: Nuevamente el UMLS utilizado en el estándar HL7 CDA y vemos ahí nuestro punto de interés ahorita que es LOINC porque es el lenguaje estandarizado para uso en Laboratorio






Figura 3: LOINC es un estándar utilizado para describir de forma estandarizada todas las observaciones médicas que se pueden hacer de un estudio de laboratorio y no es exclusiva de ningún laboratorio en particular, todo el mundo la puede utilizar.





Figura 3: Aquí observamos la complejidad que tienen los estudios de las muestras en los laboratorios, son estudios cientificos de naturaleza muy diversa y los reportes de los mismos también, pueden ser tablas, gráficos, textos o textos acompañados con imágen por ejemplo en el depto. de microbiología o histopatología.



Figura 4: Aquí observamos un LIS del depto. de Patología y vemos que también además de procesar la muestra para su análisis es importante también documentar la imagen obtenida.


Figura 5: Aquí vemos que en el LIS además de incluir los datos del paciente y información de Texto también es importante documentar lo que se observó en el microscopio en este caso que es una imagen de un tejido, quizás si hay cáncer también es importante incluir cursores y dimensionar el tamaño del tumor para indicar su grado de malignidad.





Figura 6: Aquí vemos que en el LIS también es importante documentar las enfermedades infecto-contagiosas como el Ébola o ahora el COVID porque de esa forma se puede prevenir y evitar la propagación de las enfermedades hacia otros paises vecinos, o como en el caso actual de PANDEMIA para que todos estemos preparados de forma oportuna.





Figura 7: en esta imagen se ve que el LIS y el LIMS  son sistemas muy complejos porque son muchos los pacientes que hay que atender, y son muchos los estudios que solicita un doctor de c/u de sus pacientes, más en la actualidad que se habla de hacer diagnósticos médicos basados en evidencia.




Figura 8: Aquí observamos que los estudios de laboratorio y sus resultados deben ser enviados al HIS para su ingreso en la historia Clinica de c/u de los pacientes y para poder cobrar por el estudio o buscar una forma de financiarlo en el caso de seguridad social.



Figura 9: En esta figura podemos observar que según el proveedor se puede ir poco a poco iniciando la digitalizacion del laboratorio y configurando el LIS más adecuado para el laboratorio particular de que se hable, no debemos olvidar que primero se digitalizarán los departamentos que incluyen resultados sólo con gráficos, tablas y caracteres y poco después se incorporarán los departamentos que manejan imagenes pues antes tienen que adoptar el formato DICOM que sea más apropiado a sus necesidades.



Figura 10: En esta figura se observa a unas técnicas de laboratorio que tienen que hacer estudios individualizados de muestras de sangre de pacientes, quizás esto se deba a que se necesita corroborar algún resultado de paciente con enfermedad que haya dado el equipo automatizado.  No podemos olvidar que por estándar de calidad cualquier resultado de este tipo que genere un aparato automatizado debe ser confirmado de otra manera para certificar que es real, no vaya a ser que por contaminación de la muestra se dé un resultado erróneo a un paciente y el doctor le prescriba medicamentos equivocados


No deben olvidar por favor, que gracias al LOINC , que es una base de datos mantenida por Regenstrief en donde se guardan todas las observaciones y descripciones de estas observaciones de laboratorio es que s ha podido llegar a tener y a compartir la información de estos resultados entre pares, de países muy distintos aunque no hablen el mismo idioma. 


Les anexo el link con la descripción de wikipedia de su significado




A continuación les anexo algunos videos de algunas compañías que se han dedicado a crear los software de los LIS y LIMS para laboratorios, no debemos de olvidar que cualquier compañía que se dedique a eso en la actualidad debe respetar los estándares HL7 CDA y sobre todo el LOINC, para garantizar que se puedan compartir estos datos de laboratorio y resultados médicos que a veces son de interés público y mundial, pero por bioética deben mantener de forma confidencial la identidad de los pacientes que generaron dichos resultados. 




Video 1: Retos de las pruebas de laboratorio







Video 2: Otro LIMS de otra compañía







video 3: Descripción de un LIS






Video 4: LIMS de Gemini Matrix que promete ser User Friendly 'amigable con el usuario'


Favor de contestar el siguiente cuestionario:

1. ¿Que es un LIS y cual es su impotancia?

2. ¿Cuál es el estándar para digitalizar un reporte de resultados de laboratorio de análisis clínicos?

3. ¿Quién es el que da la orden para realizar estudios de laboratorio a un paciente? favor de describir el formato de esa orden de estudios

4. ¿Que tiene que hacer un paciente de consulta externa una vez que recibe esa órden de estudios? Describir c/u de sus acciones desde que sale con la orden hasta que regresa con el doctor para saber el diagnóstico, los resultados y el tratamiento que debe seguir.

5. ¿Podrías describir al menos 7 departamentos distintos de análisis en un laboratorio de análisis clínicos? Favor de poner el propósito y una descripción general del tipo de estudio y reporte que se debe generar con los resultados.

6. ¿Si a un paciente un doctor le ordena 5 análisis distintos, podrías describir como se realizan dichos estudios desde la entrega de la orden, la toma de las muestras, el proceso de c/u en los diferentes departamentos de laboratorio, y así sucesivamente hasta la integración de los resultados en un sólo reporte para cada paciente.  Si es posible ilustra con imágenes tu respuesta.

7.  Podrias describir en base a la figura 3, que es LOINC y cómo se manejaría y administraría dicha base de datos en la actualidad, puedes consultar también el link de wiki que dí y ver las referencias para completar tu respuesta.

8. Podrías hacer un cálculo en base a indicadores estadísticos como los que se usaron en la materia de tecnología clínica ¿Cuál es la cantidad de estudios de laboratorio que se necesitan hacer diariamente para atender en un hospital público a una población de 75 000 habitantes todos derechohabientes?

9 Favor de Justificar de alguna forma porqué es importante el comunicar los resultados a la secretaria de salud o servicio de salud pública de cada país para que estén enterados, favor de ver la figura 6.

10. Favor de explicar ¿cómo deben manejarse los resultados de enfermedades infectocontagiosas como el ébola o el covid?  y explicar porqué es importante detectar de forma oportuna a los pacientes 0, 1 y 2 que presentan este tipo de padecimientos. 











































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